Създаден през 1974 година от Министерство на транспорта и Министерство на образованието като ведомствен учебен център, БМКЦ изминава дълъг път до утвърждаването си през 1989 г. като национален морски учебен център за следдипломна квалификация и обучение на специалисти за водния транспорт.
        От 2000 г. БМКЦ е самостоятелно търговско дружество, предлагащо на моряци от различни националности качествена подготовка, съгласно националните и международни стандарти за компетентност на морските лица.
       От февруари 2008 г. Центърът е еднолично акционерно Дружество 100 %
собственост на Министерство на транспорта, информационните технологии и съобщенията, а негов принципал – Министърът на транспорта, информационните технологии и съобщенията.
      Използваните в Центъра съвременни методи за обучение, непрекъснатото обновяване на техническите средства, осъвременяването на учебните програми,
привличането на преподаватели с богат практически и теоретичен опит са предпоставка за авторитета на БМКЦ сред българските учебни институции и място му в българската морска индустрия. 
    БМКЦ предлага обучения по всички глави на международната конвенция STCW'78, както е изменена, програмите за които са одобрени от Изпълнителна Агенция "Морска администрация". Обучението в голяма част от предлаганите курсове се провежда и на английски език.
    От 2003 г. БМКЦ е лицензиран от НАПОО Център за професионално обучение по
професиите: корабен моряк, рулеви, корабен моторист, корабен електротехник,
корабен готвач, корабен камериер, корабен фитер, а от 2005 г. ІІІ степен
професионална квалификация по професиите „Корабоводител” и „Корабен техник”.
   Високото ниво на учебния процес се постига с използването на най-съвременни
морски симулатори – навигационен мостик, машинно отделение и симулатор за
товарни операции с течни товари на фирма "Кьонгсберг АС", чието интегриране в
началото на 2011 г. във "виртуален кораб" разширява възможностите за обучение
на целия екипаж, по време на което сеотработват въпроси от комуникационно и експлотационно естество, възникващи при рутинна и аварийна експлоатация на кораба. Уникалността на тези симулатори, които нямат еквивалент в България е и поддържането на последни версии  на софтуера, кактоя и тяхното сертифициране от DNV.
  Голяма ефективност на обучението осигурява и реалната среда, която създават
учебния кораб “Петър Берон”, съвременни бързоходни и спасителни лодки,проти-вопожарния полигон, специализираните лаборатории, учебно-ветроходният кораб „Калиакра”, на който се обучават практиканти от различни европейски държави.
Системата за управление на качеството на БМКЦ е освидетелствана от Ллойдс
Регистър QA за съответствие със стандарта ISO 9001:2008.
 Като член на НТС, БМК, Международната асоциация за обучение по безопасност и
оцеляване на море (IASST), Международната асоциация на институциите, свързани с обучение на морски лица GLOBAL MET, Nautical Institute и др. БМКЦ работи в тясно сътрудничество с колеги от сходни учебни институции.
Съвременната учебна среда, компетентните преподаватели и инструктори, богата-та библиотека за специализирани морски публикации осигуряват на моряците доб-ро обслужване и удовлетвореност от предлаганите услуги.  Освен основната си дейност - провеждане на курсове и семинари, БМКЦ извършва малки кораборе-монтни услуги и консултиране, издателска дейност, продажба на морски публикации (IMO, ITU, NI etc).
Понастоящем в БМКЦ се провеждат над 60 вида курсове в следните тематични категории:
-всички курсове по изискванията на Международната конвенция STCW'95, както е изменена;
- симулаторни курсове за навигатори и механици;
-симулаторни курсове за товарно-разтоварни операции с течни товари
-Радиооператор за GMDSS;
-курсове за подготовка за повишаване на правоспособността за навигатори и механици;
-курсове за придобиване на ІІІ степен професионална квалификация и курсове по част от професия (моряк, корабен камериер, корабен готвач, корабен фитер, корабен моторист и корабен електротехник);
-курсове за повишаване на правоспособност - палубен боцман и рулеви
-езикови курсове;
-курсове за компютърна грамотност (Windows, Word, Excel, Powerpoint, etc)
-курсове, разработвани по заявка на корпоративни клиенти;
-оценка на знанията и уменията на персонал за различни корабни компании чрез интервюта, стандартизирани тестове, казуси на симулатор и т.п., разработени по техни изисквания
-провеждане на тестове MARLINS, за което БМКЦ е одобрен тестов център.